(一)申請

1) 申請人向分中心提出正式申請，領取《有機食品認證申請表》和交納申請費。

2) 申請人填寫《有機食品認證申請表》，領取《有機食品認證調查表》和《有機食品認證書面資料清單》等文件。

3) 分中心要求申請人按本標準的要求，建立本企業的質量管理體系、質量保證體系的技術措施和質量信息追蹤及處理體系。

(二)預審并制定初步的檢查計劃

1) 分中心對申請人預審。
預審合格，分中心將有關材料拷貝給認證中心。

2)認證中心根據分中心提供的項目情況，估算檢查時間(一般需要2次檢查:生產過程一次、 加工一次)。

3) 認證中心根據檢查時間和認證收費管理細則，制定初步檢查計劃和估算認證費用。

4) 認證中心向企業寄發《受理通知書》、《有機食品認證檢查合同》(簡稱《檢查合同》)并通知分中心。

(三)簽訂有機食品認證檢查合同

1) 申請人確認《受理通知書》后，與認證中心簽訂《檢查合同》。

2 ) 根據《檢查合同》的要求，申請人交納相關費用的 50% ，以保證認證前期工作的正常開展。

3) 申請人委派內部檢查員(生產、加工各1人)配合認證工作，并準備相關材料。

4) 所有材料均使用書面文件和電子文件各一份，拷貝給分中心。

(四)初審

1)分中心對申請者材料進行初審，對申請者進行綜合審查。

2) 分中心將審核意見和申請人的全部材料拷貝給認證中心。

3) 認證中心審查并做出"何時"進行檢查的決定。

4) 當 審查不合格，認證中心通知申請人且當年不再受理其申請。

(五)實地檢查評估

認證中心在確認申請者交納頒證所需的各項費用后。

1) 全部材料審查合格以后，認證中心派出有資質的檢查員;

2) 檢查員應從認證中心或分中心處取得申請人相關資料，依據《有機食品認證技術準則》 準則的要求，對申請人的 質量管理體系、生產過程控制體系、追蹤體系以及產地、生產、加工、倉儲、運輸、貿易等進行實地檢查評估。

3) 必要時，檢查員需對土壤、產品抽樣，由申請人將樣品送指定的質檢機構檢測。

(六)編寫檢查報告

1) 檢查員完成檢查后，按認證中心要求編寫檢查報告。

2) 檢查員在檢查完成后兩周內將檢查報告送達認證中心。

(七)綜合審查評估意見

1) 認證中心根據申請人提供的申請表、調查表等相關材料以及檢 查員的檢查報告和樣品檢驗報告等進行綜合審查評估，編制頒證評估表。

2) 提出評估意見并報技術委員會審議。

(八)認證決定人員/技術委員會決議

認證決定人員 對申請人的基本情況調查表、檢查員的檢查報告和認證中心的評估意見等材料進行全面審查，做出 同意頒證、有條件頒證、有機轉換頒證或拒絕頒證的決定 。
證書有效期為一年。

當申請項目較為復雜(如養殖、漁業、加工等項目)時，或在一段時間內(如6個月)， 召開技術委員會工作會議，對相應項目作出認證決定:

認證決定人員/技術委員會成員與申請人如有直接或間接經濟利益關系，應回避。

1) 同意頒證。
申請內容完全符合有機食品標準，頒發有機食品證書。

2) 有條件頒證。
申請內容基本符合有機食品標準，但某些方面尚需改進，在申請人書面承諾按要求進行改進以后，亦可頒發有機食品證書。

3) 有機轉換頒證。
申請人的基地進入轉換期一年以上，并繼續實施有機轉換計劃，頒發有機轉換基地證書。
從有機轉換基地收獲的產品，按照有機方式加工，可作為有機轉換產品，即"轉換期有機食品"銷售。

4) 拒絕頒證。
申請內容達不到有機食品標準要求，技術委員會拒絕頒證，并說明理由。