口腔潰瘍含漱液注冊證辦理的流程如下：

準備申請材料：包括產品技術要求及編制說明、產品說明書、生產工藝資料、產品風險分析報告等。

提交申請材料：將準備好的申請材料提交給當地的醫療器械監管部門。

審核材料：監管部門對申請材料進行審核，包括材料的完整性、真實性、合規性等。

臨床試驗：如果需要，進行臨床試驗，評估產品的安全性和有效性。

審核通過：如果審核通過，監管部門會頒發注冊證，準予上市銷售。